Automatic exploration of the natural variability of RNA non-canonical geometric patterns with a parameterized sampling technique

Théo Boury (1, 2, 3) , Vladimir Reinharz (4) , Yann Ponty (5)

1 LIX - Laboratoire d'informatique de l'École polytechnique [Palaiseau]
2 UQAM - Université du Québec à Montréal = University of Québec in Montréal
3 ENS de Lyon - École normale supérieure de Lyon
4 LaCIM - Laboratoire de combinatoire et d'informatique mathématique [Montréal]
5 AMIBIO - Algorithms and Models for Integrative BIOlogy

Mots clés: Subgraph Isomorphism; 3D RNA; Parameterized Complexity; Kink-Turn family

Domaines: Bio-informatique [q-bio.QM]; Biologie structurale [q-bio.BM]

Théo Boury, Vladimir Reinharz, Yann Ponty. Automatic exploration of the natural variability of RNA non-canonical geometric patterns with a parameterized sampling technique. Journées Ouvertes en Biologie, Informatique, et Mathématiques 2024 (JOBIM 2024), Jun 2024, Toulouse, France. ⟨hal-04575263⟩